一是对农村牧区卫生院落实了“县办县管”的管理体制，人员、业务、经费统一上划到旗卫生局管理。
对卫生院实行了“六保一不”的管理模式，收到了一定的效果。
“六保一不”即：一是确保以病人为中心的医疗工作优质高效；二是确保预防保健等社会性卫生工作任务的落实；三是确保国有资产的保值增值；四是确保专项基金的提留；五是确保养老保险金的足额缴纳；六是确保职工的最低生活保障线。“一不”就是职工工资与单位经济效益挂钩，当月不准发生亏损。这一管理模式的实施，进一步加强了对卫生院的管理，在大部分卫生院扭转了亏损的局面。
二是对卫生院的财务管理实行了财务管理制。各卫生院的收支单据必须经卫生局财务监理的审核后方可入帐。有效地规范了财务管理，杜绝了浪费现象。
三是对基层卫生院的药品采购实行了统一审批管理制度。各卫生院在采购药品前必须将品种、规格、数量、采购地点、采购价格等报送卫生局经专职人员审批后方可进行采购，从而降低了药品采购成本，让利于患者。
四是对合乡并镇后的卫生院布局进行了重新调整。重新确认了11所中心卫生院和17所卫生院。并对卫生院按重点卫生院和一般卫生院进行分类建设与管理，增强了中心卫生院的辐射带动作用，增强了重点卫生院的基本医疗服务功能。
五是在村级卫生组织的建设与管理上，坚定不移地推行了乡村医疗服务一体化管理，将村级卫生组织分为村卫生室和个体诊所两部分，村卫生室为非营利性医疗机构，承担预防保健等社会性卫生工作任务，享受国家优惠政策；个体诊所为营利性医疗机构。进一步规范了村级卫生组织的`管理，服务质量也得到了提高。
六是前些年卫生经济政策难以落实，卫生院通过职工集资的方式引进新型医疗设备，提高了卫生院的诊疗水平。
二、存在的问题
一是由于前些年卫生投入不到位，导致基层卫生院基础设施建设欠帐较多，负债经营，拖欠职工工资现象比较严重。
二是卫生院人才青黄不接的现象比较突出。近8年来没有进入大中专毕业生，亟需引进专科以上医学院校毕业生，充实基层卫生院技术力量，需要制定吸引专科以上毕业生到基层卫生院工作的优惠政策。
三是还有7所卫生院的房屋和设备没有得到更新。有3所卫生院亟待新建业务用房XX平方米。
四是基层卫生院专业技术人才的业务素质还有待于进一步提高。
五是基层卫生院的人员编制是上世纪八十年代确定的，随着业务的开展、事业的发展，应重新核实卫生院的人员编制。
三、意见和建议
1、进一步落实卫生事业补助政策，加大对卫生事业的投入，对卫生院的房屋建设、设备购置实行定额补助。
2、制定一整套卫生院吸引人才、留住人才的优惠政策，吸引专科以上毕业生到卫生院工作，落实工资和编制等待遇。
3、协调编制部门重新核定卫生院、中心卫生院人员编制。
4、在卫生院投入到位后，卫生院药品实行顺价销售或零加价销售，真正让农牧民得到实惠。
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